唐菖蒲種球質量的利害，直接關系到種植的成敗。通常可根據以下幾點舉行挑選：
①球莖的形態與大小。以選擇扁球形、中等大小的為好。球莖呈扁平的即已朽邁；球莖過大，發芽雖多但開花質量不甚良好。
②無病蟲害。挑選球莖應選無褐色或玄色病斑、無霉點與腐爛、無蟲咬過的。
③球莖上的芽眼與底部無損傷。由于芽眼是球莖栽植后萌發的部位，球莖底部是萌發根的地方，因此這兩個部位不能受到損傷，否則會影響發根和發芽，植株不能正常生長發育。
④品種要純。唐菖蒲的品種繁多，在挑選時切忌攪散，否則將得不到所需的花枝。花的顏色與球莖的顏色有一定的相關性，黃色或橙色系列的，球莖基部呈黃色；紅色系列或粉紅系列的，球莖基部呈粉紅色：白色或淺色的，球莖的色澤也較淡。