牡丹病害重要有褐斑病、紅斑病、灰霉病、根結線蟲病。

1)褐斑病重要為害葉片，初傳染時葉面呈現圓形褐色黑點，今后逐漸加深，后期呈現輪紋狀玄色霉點，嚴重時葉片枯死。防治要領實時摘除病葉殘體，以淘汰傳染源;用80％代森鋅500倍液噴施。

2)紅斑病重要為害葉片嫩莖，傳染初期葉片呈現褐色小點，今后逐漸擴大。莖部傳染呈現圓形小黑點，嚴重時呈現大面積枯死。防治要領排除病殘體，傳染較重的病株拔除銷毀;每15天噴灑1次50％多菌靈可濕性粉劑800倍液，結果較好。

3)灰霉病牡丹地上部門均可傳染，初期呈暗綠色水漬狀病斑，今后顏色加深腐朽至整個植株滅亡。防治要領制止輪作，實時排除病殘體;用70％甲基托布津可濕性粉劑1000倍液噴灑。

4)根結線蟲病重要為害須根，發生很多圓形根結。地上部門表示為生長不良，開花小甚至枯死。防治要領做好檢疫工作;泥土消毒，用15％鐵滅克每畝2.5千克用土拌勻施人。

蟲害常見的蟲害有蠐螬及吹綿介殼蟲。蠐螬為害根部，吹綿介殼蟲為害枝葉。

防治要領防治蠐螬，可用50％辛硫磷2000倍液灌或辛硫磷顆粒250克探翻入土，亦可人工捕殺成蟲;防治吹綿介殼蟲，幼蟲孵化后，噴80％敵敵畏2000倍液防治或50％馬拉硫磷1000倍液，結果較好，亦可人工刮除成蟲，再涂4-5波美度石硫臺劑掩護。