此病在北方生產球莖地區重要是球腐爛；在南方冬季促成栽植區，往往在運往市場途中，如南方運往沈陽、大連、北京的唐菖蒲鮮切花時有危害，造成花腐。

病原菌是唐菖蒲球腐葡萄孢(BotrytisgladiolorumTimmermans)，可為害植株的任何部位。罹病葉片上的病斑大小不勻，大老2厘米左右，或橢圓，呈褐色，較小的1厘米，在葉片正面上發生銹色黑點。在花梗上的黑點，開始時淺褐，以后轉深。雨后高濕時，罹病花朵基部發生軟腐，嚴重時花朵呈粘性腐爛狀。

基腐或頸腐可在任何生長階段發生，通常在天氣濕潤的雨后霧露多時，剪花后發生，病菌沿主莖傷口向下蔓延至球莖髓部；球莖基部發病的多來自母球。

在天氣轉冷濕時(溫度低于20℃)，時逢花和球莖近成熟時則易盛行。

防治措施：播種前將種球莖(去皮后)或子球，以52℃的多菌靈加百菌清500倍液，浸種30~40分鐘；球莖收后在25~28℃條件下處理一周；田間植株發病，初期以500~800倍的乙烯菌核利噴灑防治。已發生病害的地塊或保護地上所生產的花穗，在貯運、包裝銷售之前一定要以5000PPm的氨基丁烷碳酸鹽快速浸泡，或用300PPm的多菌靈或乙烯菌核利處理也可以；如用百菌清或涕泌靈升華熱粉塵處理，更平安有用，且不留痕跡。