繁殖牡丹較簡捷的方式是分株。可于秋分寒露間舉行，若生長期舉行分株，則會生長不良，甚至會造成死亡。寒冬及春季株也容易死亡。

分株時，先將植株(全株)掘起。因牡丹根較深，挖時要離根些，挖得深些。去除敗枝朽根，用利刀機動絢麗從根上劈下(或手扒也可以)，注重不使根芽損傷，每一分株保留適量的根系及頸處的蘗芽。牡丹根系肥大，容易折斷，掘起后陰干1―2天再劈。若主干是獨干或干很少，無株可分，可在春天培土高10厘米，并保持濕潤，待基部長出新枝新根，第二年秋天再舉行分株，這樣對母株便無影響。

分株后傷口處較好用硫酸銅或高錳酸鉀溶液涂抹消毒，以感染病害。選擇好合適的種植地點(陣勢稍高，排水良好，陰涼、肥沃處)挖好坑后，噴灑一些敵敵畏等藥劑防止害蟲傷根。栽植時根理直，不能扭曲。栽好覆士并踩實，延續澆幾回水，使土壤完全沉實，與根接觸密實。華北地區天寒，第一年要保護越冬，用3層舊報紙將植株包裹即可。裹前要先用草繩將枝條捆攏，捆前用一剪把葉子剪去，保留一部門葉柄的保護芽不致碰壞。第二年3月中、下旬再打開。